玄凤鹦鹉产蛋后就会进入孵化期，通常经过19天左右的孵化，雏鸟就会破壳而出。如果超出了21天，玄凤鹦鹉雏鸟还没有破壳，那么种鸟很可能会弃蛋。玄凤鹦鹉的孵化过程母鸟和公鸟都会参与，并且会进行分工合作。一般情况下，玄凤鹦鹉母鸟在白天孵化鸟蛋，公鸟在晚上进行孵化工作。
玄凤鹦鹉种鸟在进入孵化期后会比平时警惕性更高、情绪焦虑，这时候如果有陌生人靠近繁殖窝，它们容易出现过激反应，可能会踩坏鸟蛋。因此主人需要给玄凤鹦鹉种鸟提供一个尽量安静的孵化环境，不要过多的去打扰玄凤鹦鹉孵化雏鸟。
主人可以在玄凤孵化到一周左右时，寻找种鸟外出觅食的机会，拿手电筒照一下鸟蛋，看鸟蛋里是否出现红血丝，如果是白蛋则需要帮助玄凤淘汰掉，避免浪费种鸟的精力。在玄凤孵化期间，主人还要注意给种鸟准备好充足的食物和水，喂它们补充营养和体能。
